[求救] 如何比較兩個物種間的exon差異

看板Biotech作者 (胖金魚)時間16年前 (2009/11/16 15:47), 編輯推噓2(208)
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基本上就是,我有兩個物種的A基因 而因為物種間差異,使得甲物種有34個exon而乙物種只有32個 因為想要將乙物種上某個相對於甲物種第28個的exon給去掉 但是又不肯定下手的目標exon也是28號 所以想知道各個exon間的對應 如果用 Ensembl 網站又該怎麼看? 他一改版我整個就暈...... (題外話,不知道是我這邊的網路問題還是怎樣,Ensembl實在超難連,我已經試了兩小時了 就是怎麼都連不上......) -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 163.13.116.191

11/16 23:04, , 1F
ㄟ~是我的話可能土法煉鋼 把sequence找到 blast看看
11/16 23:04, 1F

11/16 23:04, , 2F
不過 應該是有更快的方法啦~
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11/17 16:28, , 3F
把全序列丟给MEGA或BIOEDIT之類的演化分析軟體alignment
11/17 16:28, 3F

11/17 16:30, , 4F
然後自己慢慢看序列比對結果...天曉得兩個物種的同源基因
11/17 16:30, 4F

11/17 16:31, , 5F
exon真的會類似嘛,有可能發生兩個exon=另一物種1個exon之類
11/17 16:31, 5F

11/17 19:29, , 6F
只比兩個物種好像看不出什麼?
11/17 19:29, 6F

11/17 19:29, , 7F
應該比較一系列物種的exon 吧
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11/17 19:30, , 8F
不同物種之 exon數目 DNA序列 蛋白質序列 motif
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11/17 19:31, , 9F
依其種屬關係ㄧ並比較 衍伸的話連同系列基因通通整理找關聯
11/17 19:31, 9F

11/17 19:31, , 10F
如果只看兩物種 之 exon 似乎看不出什麼
11/17 19:31, 10F
文章代碼(AID): #1B0GEGNK (Biotech)