[求救] 請問一下抽Gram positive細菌genomic D …
各位好
我實驗室主要操作的菌株是以放線菌中的Streptomyces為主
現在實驗室主要抽取的方式是以CTAB法為主
第一個問題是
我們在破菌的時候使用液態氮研磨的方式
會造成genomic DNA的斷裂
雖然不會全部斷掉
但是會影響到我們之後使用RE的判斷
之前我們學長姐有試過
不用液態氮研磨,只用化學藥劑的方式破菌
將菌體加入lysis buffer (Tris、10% SDS、EDTA、2% Triton-X100)
額外加lysozyme 37度 反應半小時
但是不用液態氮
破菌的效果真的是太差了
第二個問題
我們使用CTAB抽取出來的genomic DNA在跑膠的時候
會看到agarose gel有拖尾的現象
會從loading well裡面也會被染到
老師是說DNA太髒
但是我們都過幾次PCI還是一樣很髒
不過我用RE切完以後 就不會有脫尾現象
想問一下有沒有方法可以改善的??
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◆ From: 140.136.180.113
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老師希望SOUTHERN的DNA濃度要很濃會比較好 = =
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老師非常討厭用kit她覺得kit很貴 不划算,用傳統法最好 Orz...
※ 編輯: arzakiii 來自: 140.136.180.113 (11/16 16:11)
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11/16 18:07, , 4F
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