[求救] 請問一下抽Gram positive細菌genomic D …

看板Biotech作者 (Duke. Bio)時間16年前 (2009/11/15 18:53), 編輯推噓3(301)
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各位好 我實驗室主要操作的菌株是以放線菌中的Streptomyces為主 現在實驗室主要抽取的方式是以CTAB法為主 第一個問題是 我們在破菌的時候使用液態氮研磨的方式 會造成genomic DNA的斷裂 雖然不會全部斷掉 但是會影響到我們之後使用RE的判斷 之前我們學長姐有試過 不用液態氮研磨,只用化學藥劑的方式破菌 將菌體加入lysis buffer (Tris、10% SDS、EDTA、2% Triton-X100) 額外加lysozyme 37度 反應半小時 但是不用液態氮 破菌的效果真的是太差了 第二個問題 我們使用CTAB抽取出來的genomic DNA在跑膠的時候 會看到agarose gel有拖尾的現象 會從loading well裡面也會被染到 老師是說DNA太髒 但是我們都過幾次PCI還是一樣很髒 不過我用RE切完以後 就不會有脫尾現象 想問一下有沒有方法可以改善的?? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.136.180.113

11/15 20:13, , 1F
破菌時間可以久一點吧~
11/15 20:13, 1F

11/15 20:55, , 2F
做Southern嗎? 那跑膠時DNA濃度低一點吧
11/15 20:55, 2F
老師希望SOUTHERN的DNA濃度要很濃會比較好 = =

11/15 23:29, , 3F
去買抽total DNA的kit來抽ㄚ....非常快速!!
11/15 23:29, 3F
老師非常討厭用kit她覺得kit很貴 不划算,用傳統法最好 Orz... ※ 編輯: arzakiii 來自: 140.136.180.113 (11/16 16:11)

11/16 18:07, , 4F
用水煮啊,..我以前用微波耶..
11/16 18:07, 4F
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