[方法] protein denaturation

看板Biotech作者 (一起企都都轟阿)時間14年前 (2009/10/14 12:39), 編輯推噓4(409)
留言13則, 6人參與, 5年前最新討論串1/1
大家好 小弟目前在純化蛋白的時候遇到了一些瓶頸 小弟的目標是從e-coli中純化出重組蛋白 並且之後希望可以進行EMSA等能測activity的實驗 我的target protein絕大部分為solube form,inclusion body內的量很少 而我發現我的target protein會跟另外一個protein有hydrophobic interaction 我用的是TALON的Cobalt resin 抓His-tag 鹽濃度落在300~500mM 同時裡面也有加0.4%的NP-40及10%Gcerol 同時也wash很多次了 還是會有contamination 每當純化下來的時候 都會一起純化下來 而且量還不少..滿多的orz 現在我想到的方法是利用Urea先去denature這些蛋白 只是是否單純要denature蛋白也需要用到8M的高濃度?? 因為表現量不高 所以在renature透析的時候會lost掉不少 不知道能不能用低點的濃度去denature以減少透析的次數?? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.114.98.145

10/14 14:14, , 1F
還沒到不得已時,別做refolding....
10/14 14:14, 1F

10/14 14:16, , 2F
做二次純化...
10/14 14:16, 2F

10/14 15:25, , 3F
我兩個蛋白相差10kDa gel filtration 怕分不開..
10/14 15:25, 3F

10/14 17:42, , 4F
如何確定是hydropobic interaction?
10/14 17:42, 4F

10/14 17:43, , 5F
有試過單純的host會不會有這雜蛋白?
10/14 17:43, 5F
我在Host內表現三四種蛋白 其中2個是substrate (暫且稱為A) & SUMO-His 另外兩個是SUMOylation的E1、E2 已經確定會在host內進行sumoylation 而產生isopeptide bond 我想要純化這個A-SUMO-His 因為發現說不管怎麼做都會把我要的target跟A都純化下來 猜測應該是A上有motif跟SUMO作用 (突變掉之後,會改善很多,但是無法完全克服) 而查了paper是hydrophobic interaction

10/14 18:53, , 6F
調pH沉澱,高NaCl濃度低temp可降低hydrophobic interaction
10/14 18:53, 6F

10/14 18:54, , 7F
換Host,有很多方法可以改進的
10/14 18:54, 7F
不好意思 不太懂高鹽大概是指多高呢?另外我全程都是在4度操作 ※ 編輯: FUSION87 來自: 140.114.98.145 (10/14 19:21)

10/16 23:17, , 8F
NaCl濃度高低溫我倒覺得還好~不過調pH倒是有機會
10/16 23:17, 8F

10/16 23:20, , 9F
但用his純化不宜用酸性條件純化~所以pH使用上會被限制住
10/16 23:20, 9F

10/16 23:21, , 10F
所以可以考慮用陰陽離子純化後再串聯his-taq
10/16 23:21, 10F

10/16 23:22, , 11F
另外硫胺也可以考慮做看看~加油吧!!
10/16 23:22, 11F

11/11 01:47, , 12F
NaCl濃度高低溫我倒 https://muxiv.com
11/11 01:47, 12F

01/03 17:02, 5年前 , 13F
另外硫胺也可以考慮做看 http://yofuk.com
01/03 17:02, 13F
文章代碼(AID): #1ArLNiA1 (Biotech)