[求救] Western的band不在正確的位置上

看板Biotech作者 (無色)時間16年前 (2009/05/14 13:28), 編輯推噓6(607)
留言13則, 7人參與, 7年前最新討論串1/1
因為已經重做到快發瘋了,希望板上好心的大家救我 我要看的protein是mmp-1,52kDa 一開始做一抗用1:1000都跑不出band來,曝光很久也沒有,背景變很黑 之後改成1:400,可以看到一點點band,出現在43kDa~55kDa的位置(比較靠近55) 之後我把膠跑的比較久,讓它們跑開一點(43~55差了1.5公分) 因為要同時看actin所以我通常都會從43~55中間剪開(剪的位置稍微靠近43,大概是1:2) 結果剪到actin的上緣(actin比43kDa的marker約高了0.5公分) 學姐跟我說我要以actin為準來看蛋白的位置 讓我很頭痛 因為55kDa的marker下面0.4公分的地方有很模糊的band 0.3公分的地方有更淡更淡的band 55kDa上方0.3公分的地方也有一條更清楚的band 可是我的抗體是同時可以看mmp-1跟mmp-8(52kDa跟65kDa) 所以現在我根本不知道哪一條才是正確的 而且我之前做marker也不會不準,但是我沒有跑那麼開過 marker是Fermentas的0671,protein煮7分鐘 以下是示意圖   拜託大家救救我〒△〒 ┌───────────┐ │ │ │ ╴╴╴╴╴╴╴╴╴ │ 55 │—﹍﹍﹍﹍﹍﹍﹍﹍﹍ │ │ ﹊﹊﹊﹊﹊﹊﹊﹊﹊ │ ╠═▂▂▂▂▂▂▂▂▂═╣←剪開 43 │— │ │ │ └───────────┘ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.128.64.100

05/14 13:46, , 1F
可以考慮不剪 先做目標蛋白 再STRIP 換看actin
05/14 13:46, 1F

05/14 14:19, , 2F
我也遇到同樣的問題...
05/14 14:19, 2F

05/14 14:21, , 3F
用0671這支marker來對b-actin 位置總是會游超過43kD...
05/14 14:21, 3F

05/14 19:27, , 4F
我是認為差不多 應該就可以了吧 marker大小也不一定準
05/14 19:27, 4F

05/14 19:28, , 5F
我看我的0671 的說明書 也不是43 而是40kD,所以大小不會差
05/14 19:28, 5F

05/14 19:28, , 6F
太多就可以了
05/14 19:28, 6F

05/14 22:05, , 7F
提供給你參考
05/14 22:05, 7F

05/14 22:32, , 8F
那個..SDS PAGE的band位置跟marker不會完全準
05/14 22:32, 8F

05/14 22:32, , 9F
那個東西看相對就好 不要差到太大就可接受
05/14 22:32, 9F

05/16 16:14, , 10F
感謝大家 我下週要重做了 唉~
05/16 16:14, 10F

05/18 00:09, , 11F
GAPDH保證在43kd下
05/18 00:09, 11F

11/11 01:28, , 12F
我也遇到同樣的問題.. https://noxiv.com
11/11 01:28, 12F

01/03 16:55, 7年前 , 13F
那個..SDS PAG https://daxiv.com
01/03 16:55, 13F
文章代碼(AID): #1A2wmEDy (Biotech)