[討論] 植物組織的total RNA isolation

看板Biotech作者 (rearrangement)時間15年前 (2009/05/08 11:55), 編輯推噓4(405)
留言9則, 4人參與, 最新討論串1/1
首先感謝各位大大在前面的提問中給了我很多清晰的想法 看熟protocol之後再爬完所有跟RNA有關的文章 原本要請別的實驗室的學姊帶一次的 不過今天去找學姊 學姊回家過媽媽節了QQ 我打算稱明天老闆不再的時候自己先玩兩把 但是怕有什麼遺漏 所以想跟大家討論我初步的protocol 我們的酵素是水解代謝的酵素 所以我打算去隔壁農場借一株比較嫩的芋頭 挖起來然後拎回實驗室後 先取一兩片嫩葉 再挖一兩塊芋頭和莖交接處的肉 我有兩套mortar 所以可以一起處理 1. 把組織約1-2g先用滅菌過的剪刀和刀片初步破碎 然後再放置到液態氮的mortar中 加入bead磨碎 2. 等液態氮揮發到快乾之後取約100m放入1.5ml eppendorf,加入1ml trizol,vortex 3min 加入200ul chloroform, vortex 1min, 4度離心 14000rpm 15min 3. 取上清液換新tube(不抽到接近分層),加入500ul ISP,靜置 10min,14000rpm 10min 4. 倒上清液,75%EtOH 1ml wash pellet,14000rpm 10min 5. 倒上清液,靜置陰乾(看他多久才會快乾) 6. 用20ul RNase free water回溶 實驗結果判別 1. 取5ul + 495ul RNase free water 測260/280 2. 取5ul跑電泳(1%agarose,TAE-fresh prepared,100V 15min) 以上.... 不知道有沒有什麼遺漏或錯誤的步驟 還有vortex和不需vortex的步驟應該沒有搞錯吧 有錯誤的地方修改一下明天就拿這套protocol衝了~~~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 163.13.115.38

05/08 12:27, , 1F
trizol的protocal應該是不會有啥問題,怕的是trizol抽不出來
05/08 12:27, 1F

05/08 12:28, , 2F
不過我沒做過芋頭的,就等你試試啦XD
05/08 12:28, 2F

05/08 12:29, , 3F
跑RNA要用RNA電泳呦
05/08 12:29, 3F

05/08 12:38, , 4F
這兩天爬文看不少人用TAE跑應該OK吧 那個MXX的我們沒阿><
05/08 12:38, 4F

05/08 12:53, , 5F
step 5 可用tip幫助吸乾 別吸到pellet就好 放冰上陰乾
05/08 12:53, 5F

05/08 12:55, , 6F
放冰上陰乾的話要多久阿? 第一次玩我想盯著看XD
05/08 12:55, 6F

05/08 13:19, , 7F
冰上很久
05/08 13:19, 7F

05/09 17:33, , 8F
用倒的 陰乾很久 吸乾的話 我放5-10min 就回溶了
05/09 17:33, 8F

05/10 15:52, , 9F
恩 我決定用吸的 然後離心在吸 最後陰乾~~~
05/10 15:52, 9F
文章代碼(AID): #1A0wqdyv (Biotech)