[求救] 選擇SNP SITE的方法?

看板Biotech作者 (阿杰)時間15年前 (2009/04/01 16:19), 編輯推噓5(501)
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目前選了很多個可能要看的SNP SITE 老闆說有一個方法可以篩選出我們要的SNP SITE 不知道這個方法是什麼 我找了一陣子沒有頭緒 請有經驗的人能提供一下方向嗎 謝謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.116.116

04/01 16:56, , 1F
PCR 然後用限制媒切
04/01 16:56, 1F

04/01 19:48, , 2F
NCBI找他的ratio 高的表示變異性大 再看你的檢體來源?
04/01 19:48, 2F

04/01 20:00, , 3F
應該是畫出LD plot找出合適的,或找已認為的tag-SNP
04/01 20:00, 3F

04/01 22:29, , 4F
可以用hapmap看看,去找找看有沒有適合你們的tag-SNPs
04/01 22:29, 4F

04/02 20:49, , 5F
謝謝各位的意見!~
04/02 20:49, 5F

04/04 21:23, , 6F
1F的方法是CAPS 很好用~也很準確!!
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文章代碼(AID): #19qoEBhk (Biotech)