[求救] RNase 加入的時機

看板Biotech作者 (平淡 超凡品味!)時間17年前 (2009/01/18 17:50), 編輯推噓7(7021)
留言28則, 8人參與, 7年前最新討論串1/1
最近再抽植物(多醣體很多)的DNA 剛開始是依照實驗室給的步驟 (CTAB) 方式抽取 不過產量一直不是很高 >"< 被老闆嫌棄 此方法跟我在很多書上看到的最大不同處是RNase加入的時機以及分量.... 我先po一下步驟 1.取CTAB extraction buffer + PVPP + B-Me 65度c預熱1小時 2.將粉末狀的樣品倒入步驟1.所配置的 buffer 並加入50ul RNase (10mg/ml) 與 75ul Protase (20mg/ml) 混合均勻後至於65度c反應1小時 3.加入等量CIA離心 今天~剛剛加入異丙醇得到的量超少 =口= 沒有麵線狀的產物出現...... 與我前天沒有加入RNase與Protase 的結果差很多~ 加入異丙醇後可看見很多絲狀物 ~ 糾結在一起 所以我一直認為~是RNase的關係.... 我看到的都是在經過CIA處理後 才加入~ 不過還沒跟老闆討論 = = 因為一分證據說一分話.... 他一直覺得是我實驗手法的問題 =口= (我進實驗室6個月) 到底 >"< ..... 而且......學長有說過~PVPP會與.....結合.... 導至DNA...... 我沒聽清楚 ~囧 哪位好心人可以給我建議嗎? T^T 感激不盡~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.120.190.74

01/18 18:06, , 1F
你的方法好像只是粗萃取...後面沒了嗎!? isp加入之後的絲
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01/18 18:08, , 2F
狀物是DNA~ 我們家RNase加的時機在isp之後~重新回溶DNA時加
01/18 18:08, 2F

01/18 18:09, , 3F
pvpp移除酚類化合物~避免影響DNA品質!!
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01/18 18:11, , 4F
還有一個原因...你樣品真的磨的夠碎嗎!!這也是可能發生的~
01/18 18:11, 4F

01/18 19:44, , 5F
後面步驟還有~只是我寫下我有疑惑的地方.....
01/18 19:44, 5F

01/18 19:45, , 6F
要怎麼判斷樣本磨得夠不夠碎~ 學長說要像奶粉一樣 ~"~
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01/18 19:48, , 7F
後面的步驟是 CTAB/NaCl→CTAB 沉澱液→ 離心→高鹽TE→
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01/18 19:50, , 8F
+ isp→ 離心 →80%酒精清洗→回溶→測O.D
01/18 19:50, 8F

01/18 19:51, , 9F
RNase的量真的不會太多嗎? 學姐說因為是在前面加~
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01/18 19:52, , 10F
雜質比較多~所以量要用多一點
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01/19 11:17, , 11F
請問一下你為何覺得影響產量是RNase的緣故?
01/19 11:17, 11F

01/19 11:19, , 12F
另外你好像缺寫樣品秤多少量去加入50ul RNase...
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01/19 11:25, , 13F
樣品體積跟濃度都會影響加下去時的外觀,另外你是用生長旺盛
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01/19 11:25, , 14F
時期的樣品還是有點老化的樣品也會影響DNA量...
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01/19 11:26, , 15F
RNase在理論上及我CTAB使用的經驗來看是沒有影響...
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01/19 13:52, , 16F
buffer 跟 sample 比 不要太低
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01/19 17:39, , 17F
抽那麼多DNA做什麼用? 往後要做的實驗作的出來就好好
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01/19 17:41, , 18F
用KIT輔助也可,每個數據要求完美是沒意義的。。
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01/19 20:57, , 19F
老闆通常要求完美.....這是最大的問題!!!
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01/19 20:58, , 20F
RNase應該是不會影響DNA的量...主要是樣品本身的問題!
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01/19 21:00, , 21F
是不是幼嫩新生組織..或者是像你老闆說的手法~不夠碎
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01/20 01:43, , 22F
每個人聽到我加50ul~都被嚇到 = = sample取幼嫩的葉子
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01/20 01:46, , 23F
還有~我看最初的書上是沒有加RNase所以我才覺得是這問題
01/20 01:46, 23F

01/20 01:48, , 24F
我知道小的完整幼葉與大片老葉的細胞數是一樣多~
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01/22 11:41, , 25F
石頭的石?叔頭的叔
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01/22 21:28, , 26F
居然會遇到熟人..... = =
01/22 21:28, 26F

11/11 01:15, , 27F
石頭的石?叔頭的叔 https://noxiv.com
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01/03 16:50, 7年前 , 28F
buffer 跟 sa https://noxiv.com
01/03 16:50, 28F
文章代碼(AID): #19SljZpT (Biotech)