[求救] double digest

看板Biotech作者 (!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!)時間15年前 (2008/11/26 03:44), 編輯推噓2(204)
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我要進行 HindIII 和 BamHI 的 double digest 根據 New Engalnd Biolabs (NEB), HindIII 用 NEB 2 Buffer BamHI 用 NEB "U" Buffer NEB 有加以附註 這兩個 enzymes 不適合 double digestion. 要進行 sequential digestion. 請問有人做過 HindIII 和 BamHI 的 double digest 嗎? 可以大略解釋為何 NEB 有這樣的註明? 我有注意到: 1. BamHI 用 NEB 2 Buffer 的 efficiency 是 100% 2. HindIII 用 NEB "U" Buffer 的 efficiency 是 10% 問題: 1. 如果 BamHI 在 NEB 2 Buffer 中有 100% efficiency, 為何還需要用特殊的 NEB "U" Buffer? 2. 我可以理解如果 double digest 在 NEB "U" Buffer 中進行, HindIII 可能會切不好 (畢竟才 10% 而已). 那如果我用 NEB 2 Buffer 呢? 3. 還是說, 除了 buffer 相容性以外, 還有一些特殊理由這兩個 enzymes 一定要進行 sequential digest? 謝謝大家所能提供的建議 :) -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 130.189.202.86

11/26 12:13, , 1F
我查BamHI是建議用 buffer2 並且有註明 dd
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11/26 12:15, , 2F
dd指 若要double digest請用buffer3 可減少star activity
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11/26 12:16, , 3F
不過HindIII 只適合在buffer2 所以建議就分開切
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11/26 14:33, , 4F
舊的NEB chart的確用U,我們lab有還有,但新的都改成buffer 3
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11/26 14:35, , 5F
對於BamH1的描述與使用,請參考NEB網站會有說明
11/26 14:35, 5F

11/27 01:39, , 6F
tks!!
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文章代碼(AID): #19B5MdBc (Biotech)