[討論] 請問EtBr與核酸

看板Biotech作者 (不以物喜不以己悲)時間17年前 (2008/10/30 12:27), 編輯推噓7(707)
留言14則, 6人參與, 7年前最新討論串1/1
請問大家 我學到的知識告訴我,EtBr會鑲嵌到DNA的雙股結構 Q1:所以 EtBr只會染雙股? 那PCR時 run gel 時,染過EtBr後,膠最下面會有淡淡的一團 應該是primer Q2:primer應該是單股,所以EtBr可以染到單股? 或是染到的是已經由單股anneal成雙股 or dimer? Q3:RNA也可以run gel,為什麼單股RNA可以染到? 或是 染到的是已經有2nd 結構的RNA? 很基本的問題,但是不太清楚,想問大家,謝謝 -- im a good student -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.77.7 ※ 編輯: bicon 來自: 140.129.77.7 (10/30 12:29) ※ 編輯: bicon 來自: 140.129.77.7 (10/30 12:33)

10/30 13:02, , 1F
1.Primer dimer 2.RNA secondary structure
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10/30 13:31, , 2F
雖然說是鑲嵌,但是還是基於親水舒水親和力的關係
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10/30 13:32, , 3F
可以wiki一下EtBr的結構,有解釋到某些部位會跟疏水區域親合
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10/30 13:32, , 4F
疏水(第一行打錯
10/30 13:32, 4F

10/30 15:03, , 5F
搭順風車問一下 那RNA跑變性電泳還是可以用EtBr染
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10/30 15:03, , 6F
可是變性之後還會有secondary structure嗎 謝謝><
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10/30 18:03, , 7F
RNA在變性電泳後依舊可用EtBr染色,並非全部靠2nd結構
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10/30 18:03, , 8F
來使RNA被EtBr染色
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11/01 00:43, , 9F
想順道請問一下 primer之間沒有互補關係 如何形成dimer
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11/01 12:16, , 10F
簡單說要是兩個片段上都有GCGC這種連續的片段就會有dimer
11/01 12:16, 10F

11/01 12:17, , 11F
不需要完全互補,連續3個鹼基就會互粘...
11/01 12:17, 11F

11/03 11:53, , 12F
了解哩 謝謝^^
11/03 11:53, 12F

11/11 01:06, , 13F
雖然說是鑲嵌,但是還是 https://daxiv.com
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01/03 16:47, 7年前 , 14F
簡單說要是兩個片段上都 https://noxiv.com
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文章代碼(AID): #192JULdE (Biotech)