[求救] 請問如何從protein 的id得到gene ontology的id

看板Biotech作者 (??)時間17年前 (2008/07/25 17:40), 編輯推噓0(000)
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抱歉 我不知道要po在哪個版比較好 如果我po錯地方的話會自D 最近有需要做這個動作 拿到一筆fasta的資料之後 取得此fasta的id(我不知道是不是這樣稱呼) 比方說: >Q85A69 MSILVYEVSKSLGNLKVLDRVS..... 我就需要將 "Q85A69"取出來(聽說每個資料庫對同一筆蛋白質fasta會取不一樣的名字) 然後找出他對應的所有gene ontology id(比方說GO:0016740) 我有去http://www.geneontology.org/下載他的一些資料庫 可是我在資料庫的內容當中找不到Q85A69這種格式的對應id 可否有強者可以告訴我查詢的tool或者方法 因為要做大量的資料處理 希望能夠得到離線版的tool 謝謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.121.198.7
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