[求救] real-time primer 設計

看板Biotech作者 (Homer)時間16年前 (2008/07/15 10:27), 編輯推噓2(202)
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我對於Q-PCR的接觸只有幾次而已, 但是老師要我做Q-PCR的相對定量比較 最近一直卡在primer這關 一直都在最一開始測condition時就發現很不專一的情形。 由於之前學姊都用beacon designer設計primer 但是現在學校授權沒了, 無法比對2級結構。 所以我用taqman設計, 但是一設計就好多, 不太知道哪個是合適的primer。 而且beacon會作物種比對,taqman好像沒有 所以我想請問大家都怎麼設計的 還是說用一般的設計軟體就好? 我在網路上有看到primerbank這個網站, 不知它提供的primer專一度高不高? 請大家幫我解惑,謝謝。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.121.179.203

07/15 21:47, , 1F
去 ncbi 做 blast
07/15 21:47, 1F

07/16 00:08, , 2F
RTprimerDB可以直接找到已知有的序列可用
07/16 00:08, 2F

07/16 00:09, , 3F
要看二級結構,羅式ABI軟體都可參考
07/16 00:09, 3F

07/16 00:10, , 4F
專一性的問題在道ncbi做blast....三個步驟一起跑.
07/16 00:10, 4F
文章代碼(AID): #18V0iCx- (Biotech)