[求救] 關於細菌16s rDNA定序使用引子
請問如果是一未知菌種利用定序取得16s rDNA序列,再利用BLAST比對搜尋最相近物種
該使用哪一片段引子較好呢?
我看過的資料有只讀順向(519F)取得較短片段
也有讀取雙向(T7 及 SP6)取得較長片段
但讀取雙向或單向,或者讀取的片段長短不同攸關到所花費成本的高低
請問對於需要做到物種比對而言,該如何選擇引子???
如果我只讀取單向大概可以得到800-900bp的序列,這長度足以讓我辨識物種嗎?
謝謝^^
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