[求救] IP和antibody的使用

看板Biotech作者 (...)時間18年前 (2008/04/10 14:33), 編輯推噓5(502)
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這個實驗我做很久了還是做不出來 希望有經驗的大大可以給我建議,狀況來了,請接招 ----------------------------------------------------------- 狀況來了的分隔線 狀況來了的分隔線 狀況來了的分隔線 ----------------------------------------------------------- 我想要用western blot看一個endogenous的protein expression 不過這個protein目前市面上沒有賣,所以我們lab由我來純化蛋白(含HA-tag) 做出hybridoma之後拿去打老鼠,從其中腹水大量取得之後要用的ab 經過用western blot測試,我的ab是可以用在這個蛋白的偵測 因為這個protein在細胞中的表現量很低,一直沒辦法直接測到endogenous expression 所以老闆建議我用IP-western的方法,也許可以得到結果 在還沒開始進行實驗前我想說先找到這個ab做IP最好的條件 所以我先做transient transfection, positive control用anti-HA ab來做IP (5ul of ascites in 1 ml RIPA) O/N 我自己做的ab在一樣的條件下也是加5ul做IP western出來的結果是看不到我要的band,不過positive有出來 想說也許是epitope躲在內部,所以我也試過先denature protein再IP 不過還是得到一樣的結果,各種IP的protocol我也試的差不多了 不知道各位有什麼建議? 為什麼western可以用的ab在IP就不能用了? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 75.47.195.107

04/10 15:37, , 1F
我猜 因為western的ab是認直線狀的peptide,可是IP要認的
04/10 15:37, 1F

04/10 15:38, , 2F
是conformation (native protein),所以才會有此差異
04/10 15:38, 2F

04/10 16:27, , 3F
IP認的不一定是結構...
04/10 16:27, 3F

04/10 18:49, , 4F
你的denature protein是怎樣denature?!+2-ME?100度煮過?!
04/10 18:49, 4F

04/10 23:48, , 5F
你的immune用的protein是用peptide 還是 whole protein?
04/10 23:48, 5F

04/11 02:25, , 6F
我是有加2-me,也有煮,ab是用whole protein去製造的
04/11 02:25, 6F

04/12 11:47, , 7F
恩~看起來會是同1樓說得那樣~認的conformation不同,一個
04/12 11:47, 7F
文章代碼(AID): #17_RIeIX (Biotech)