[求救] DNA isolation by Trizol

看板Biotech作者 (mao)時間18年前 (2008/01/09 14:24), 編輯推噓10(1002)
留言12則, 7人參與, 最新討論串1/1
我最近開始用trizol抽DNA , 之前完全沒有試過, 按照別人給的protocol操作, 結果最後測OD時有一管為0,沒有DNA 一管為0.9mg/ml,但260/280=0.3, DNA濃度很低且不夠pure 請各位有經驗的人幫我看一下是出了啥問題? ~~謝謝大家~~ 我的protocol如下 1. cell pellet + Trizol 1 ml, vortex 2. 55度C, 10 mins 3. add 200 ul Chloroform, vortex 4. 靜置5 mins 5. spin 1200 rpm, 15 mins, 4度C 6. 移除上清液, 取出中間層白色部份DNA 7. add 300 ul 100% ethanol, vortex, 靜置3 mins 8. spin 12000 rpm, 5 mins, 4度C 9. add 1 ml 0.1M Sodium Citrate in 10% ethanol 室溫上下翻轉30 mins 10. spin 8000 rpm, 10 mins, 4度C 11. 移除上清液,重複9.10步驟 12. add 1 ml 75% ethanol,室溫上下翻轉10 mins 13. spin 8000 rpm, 10 mins, 4度C, 移除上清液 14. air dry 5 mins 15. add 50 ul TE buffer, 65度C 30 mins, 加熱過程中vortex數次 16. 測OD -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.134.146

01/09 14:51, , 1F
你確定是中間層嗎 ? @@
01/09 14:51, 1F

01/09 15:23, , 2F
我記得是中間層沒錯 這部份可以繼續分出DNA and protein
01/09 15:23, 2F

01/09 16:02, , 3F
照他的protocol看來 不需把中間層取出 直接加100%酒精即可
01/09 16:02, 3F

01/09 16:08, , 4F
你第6步有問題應該不是中間層,而是轉置上清液吧...
01/09 16:08, 4F

01/09 16:14, , 5F
還有chloroform離心完,中間那一層是蛋白跟細胞碎片...
01/09 16:14, 5F

01/09 16:16, , 6F
建議去找一下官方protocal...
01/09 16:16, 6F

01/09 16:18, , 7F
第六步我覺得是取出上清液,網路上再check一下吧
01/09 16:18, 7F

01/09 16:29, , 8F
第六步上清液是分RNA用 剩下的有機層可分DNA及Protein
01/09 16:29, 8F

01/09 16:30, , 9F
之後加EtOH 沉澱物是DNA 上清再加isopropanol 沉澱得到蛋白
01/09 16:30, 9F


01/09 22:30, , 11F
DNA還是用別的方法抽比較好
01/09 22:30, 11F

01/10 00:02, , 12F
如果你沒有同時要RNA,用其他方法會比用Trizol好吧。
01/10 00:02, 12F
文章代碼(AID): #17X6YxuS (Biotech)