[轉錄]Re: 請問生物常識

看板Biotech作者 (嗨北鼻)時間18年前 (2007/09/29 16:07), 編輯推噓4(400)
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※ [本文轉錄自 Biology 看板] 作者: biolenz (lenz) 看板: Biology 標題: Re: 請問生物常識 時間: Sat Sep 29 06:20:55 2007 我老是喜歡回這種問題,我想是因為發揮空間大一點吧 XD ※ 引述《scal (THE YANKEES)》之銘言: : 請問各位 我在雜誌上看到 現在有些科計 ^^^^ 的確,在 Nature,Science 與 PNAS 這些雜誌上呢,有這麼一些新的科技, 可以更快速地 "決定 DNA 的長度",我想你這裡的意思應該是 "定序"。 否則長度跑膠不就得知? : 是可以用更快速的方法決定DNA的長度 : 我的問題是 問甚麼要知道DNA的長度呢? : 謝謝 假設你問的是定序的話,那現今的方式多數使用 PCR (polymerase chain reaction) 材料丟進去,放在一個控溫器裡頭就可以進行了,然後跑膠,就可以測知序列。 雖然已經很快,但是因為有一些些麻煩,所以有些人研究了新的定序方法。 有 review 的 paper "Emerging technologies in DNA sequencing" 可以自己 google 找一下 主要新發展的技術舉列如下 1. 奈米孔定序法 (Nanopore sequencing) 2. 焦磷酸定序法 (Pyrosequencing) (這已經商品化了) 奈米孔定序法的雜誌文章標題為 Characterization of individual polynucleotide molecules using a membrane channel 意思是讓單股的 RNA 或是 DNA 穿過ㄧ個膜的孔洞,穿過孔洞時, 因為 ATCG 結構的不同。會導致該孔洞電位的改變。這些電位改變的資訊可以 轉化為 ATCG 從而達成定序。原理上只要有一條 RNA 或是 DNA 就可以定序得到。 而且前處理只要將 DNA 弄成單股即可,不過正在發展當中,有興趣利用 Nanopore sequencing 為關鍵字去搜尋看看,圖解說明如下: http://tinyurl.com/yqvc7k 焦磷酸定序法則是利用 DNA 合成時會放出一個 PiPi 的特性,加入與 PiPi 反應 會產生螢光的物質,則當我依序投入 ACTG 到反應中時,唯有正確的序列才會 有螢光反應,藉此定序。已商品化,國內有些學校已經有了。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.127.160.142 ※ 編輯: biolenz 來自: 140.127.160.142 (09/29 06:22)

09/29 10:54,
推~
09/29 10:54
-- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 133.11.50.150

09/29 16:38, , 1F
第二種呀..不是只能定小片段,像偵測SNP,長片段應該很慢
09/29 16:38, 1F

09/29 20:17, , 2F

09/29 20:29, , 3F
早有定序儀運用pyrosequencing 第二個連結是原理的動畫
09/29 20:29, 3F

09/29 22:56, , 4F
喔,這是genome scale的定序,層級果然有差
09/29 22:56, 4F
文章代碼(AID): #16_WUvV- (Biotech)