[問題] 分子生物學的解螺旋問題！

看板Biology作者 (jimmy)時間7年前 (2017/04/02 19:27), 編輯推噓2(2推 0噓 31→)
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目前我對超螺旋的理解是 當變緊時會正超螺旋，變鬆的話會負超螺旋 問題出在細菌在複製時是正超螺旋，但原因是 1、解螺旋時硬往兩邊扯，讓兩邊變緊 還是 2、解螺旋時是用別的方法，讓turn數真的減少，再根據公式得到w應該為正 哪一個呢？ 原本我查維基以為是2 直到我看到真核的圖 http://i.imgur.com/FxTXSh7.jpg
那為什麼又變前正後負呢？ 到底解螺旋酶怎麼作用的！？ 感謝大家救救大一菜逼八嗚嗚 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 114.137.170.143 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biology/M.1491132468.A.CBD.html
推
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Topoisomerase不就是用來解決超螺旋的問題嗎？
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我想說的是解旋酶，helicase
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topoisomer是拓樸酶吧~
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Topoisomerase就是被用來解琁的
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不要被中文騙了......
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樓上幾樓都誤會了，我知道拓樸酶可以解決超螺旋的
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問題，但這跟我要問的問題沒關係。我要問的是當複
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製時，helicase會讓複製叉不斷往兩邊前進，那為什
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麼兩邊一邊是正超螺旋一邊是負超螺旋呢？不是應該
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兩邊都是正嗎？
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推
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原po您對supercoil的理解並不全部正確
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當dna topology structure發生改變時topology的淨值不會
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改變一端變正另一端變負我不是專門做topoisomerase能回
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答的相當有限要是謝道時老師還在世他一定會很樂意教到您
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會
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解旋時，DNA的"末端"會轉動嗎? 如果不會，那麼整個DNA分子
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內的總旋轉角度就不會改變。 就如同樓上的第二句所說。
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總旋轉角度不變的情況，一段被旋鬆，另一段就會變緊。
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但事實不只是如此，因為1)DNA的可以被剪斷;2)末端可以轉動
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3)DNA可能是個loop(例如細菌)。
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原則上2和3應該都很好想像，我也不多做解釋。
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1的情況，我稍做解釋。DNA會有旋轉度，追根究柢是根基於DNA
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乃是兩股分子鏈。拿乙烷CH3CH3和乙烯CH2CH2做比較，乙烷的
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兩個碳之間，可以自由的無限轉動，因為epsilon鍵是1維的，
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乙烯的兩個碳，則不能任意轉動，因為pi鍵是2維的。DNA剛好
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單鏈的"鏈"上都有這些能自由轉動的單鍵。但雙股DNA就不能自
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由轉了。因為兩條不重疊的線，最少要一個2維平面才能存在。
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因此雙股DNA不能任意轉動，要轉動就會產生扭力。形成巨結構
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就是通過那些蛋白質的吸引來提供扭力。
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(當然的，DNA有天然的扭轉度，所以有"雙螺旋"和"超螺旋")
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然後，重點，重點是，雙DNA在複製時，會被剪開。剪開的DNA
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就自由了(或者可理解成DNA變成4個末端)。這時候超螺旋的結
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構就可以轉動這個新形成的末端，來改變分子內的總旋轉度。
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